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    qPCR基線和閾值的概念及設置方法

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    圖2.擴增曲線顯示了設置不當?shù)幕€ (A) 和設置正確的基線 (B)。



    閾值的設置

    Applied Biosystems?提供兩種閾值設置方法:自動和手動。自動設置中,軟件將自動選擇閾值,此閾值更適合平臺更高的曲線 (圖3中的藍色曲線)。然而這將導致此數(shù)據(jù)組中的紅色曲線的 Ct 值出現(xiàn)偏差,因為其至佳閾值比此值更低。通常情況下,默認設置通常已十分適當,但也可將閾值手動拖至指數(shù)期中間,以獲得更高的準確度。因此,需對每個數(shù)據(jù)組進行獨立研究,這樣才能根據(jù)具體情形選擇至佳閾值。


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    圖3.對數(shù)曲線屏幕截圖顯示了兩組曲線,它們的平臺高度和指數(shù)期不同。擴增曲線中確定 Ct 的至準確部分位于對數(shù)曲線指數(shù)期的中間。至佳閾值設置有時因各組數(shù)據(jù)的不同而異。


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